どちらがマシであるかという言い方で申し訳ありませんが、玉減りなしの方がボーダー算出条件とのギャップが少なるためよろしいのではないかと思われます。

もしボーダーを意識した計算をするのであれば、仕事量ツールの方が細かく設定できますので、ユーザー様の目的に沿っていると思われます。

下記のように設定にするのがよろしいかと存じます。

[基準値1000円の場合]
貸玉設定→1.00円→1000個
交換設定→1.00円→1000個

[基準値200円の場合]
貸玉設定→1.00円→200個
交換設定→1.00円→200個